Post-doctorant F/H auprès du Professeur Denis DUBOULE

Missions
En tant que chercheur /chercheuse en génétique spécialisé dans la culture d'organoïdes, vous participerez à des projets en cours et optimiserez des modèles embryonnaires à partir de cellules souches. Vous serez notamment chargé.e de mettre en œuvre des expériences de modification génétique de cellules souches (CRISPR-Cas9, RNAi), de produire des pseudo-embryons, ainsi que d'effectuer des analyses transcriptomiques et protéomiques, accompagnées d'expériences d'imagerie avancée. Vous traiterez et interpréterez également les données bioinformatiques issues du séquençage et de l'analyse spatiale. Enfin, vous valoriserez vos recherches par des publications, des collaborations et des présentations scientifiques.

MissionsEn tant que chercheur /chercheuse en génétique spécialisé dans la culture d'organoïdes, vous participerez à des projets en cours et optimiserez des modèles embryonnaires à partir de cellules souches. Vous serez notamment chargé.e de mettre en œuvre des expériences de modification génétique de cellules souches (CRISPR-Cas9, RNAi), de produire des pseudo-embryons, ainsi que d'effectuer des analyses transcriptomiques et protéomiques, accompagnées d'expériences d'imagerie avancée. Vous traiterez et interpréterez également les données bioinformatiques issues du séquençage et de l'analyse spatiale. Enfin, vous valoriserez vos recherches par des publications, des collaborations et des présentations scientifiques.Institution singulière en France, sans équivalent à l’étranger, le Collège de France occupe une situation à part dans la recherche fondamentale et l’enseignement supérieur français. Le Collège de France a pour mission de contribuer au développement et au progrès de la science et de la culture, de promouvoir la recherche et d’en diffuser les résultats par des enseignements, des missions et des publications. Les enseignements sont délivrés sans condition d’accès et sans finalité de grade ou de diplôme. Ils sont organisés dans des conditions fixées par l’assemblée du Collège de France. Activités principales-      Assurer une assistance technique à l'équipe de recherche en terme de matériel de culture cellulaire et de gestion des lignées de cellules-      Réaliser et mettre au point des expériences de culture cellulaire et de biologie moléculaire en adap- tant les protocoles-      Recueillir et mettre en forme les informations nécessaires à la bonne conduite de l'expérimentation : cahier de laboratoire, registres-      Assurer la gestion des stocks, des commandes et de la facturation-      Assurer le suivi de l'entretien et de la maintenance du matériel et des équipements-      Préparer, traiter et analyser les échantillons-      Former techniquement des stagiaires et des étudiantsCompétences requises-      Expertise en biologie moléculaire : biologie du développement, évolution, techniques de laboratoire humides et sèches-      Compétences avancées en bioinformatique : analyse de données omiques (bulk and single cell, specially snATAC), développement de pipelines d’analyse-      Maîtrise des langages de programmation : R (avancé), Python (avancé), Bash (intermédiaire)-      Compétences linguistiques : anglais (niveau C2 - Proficiency), français (niveau B1)-      Capacité à travailler en équipe et dans des environnements de recherche internationauxCompétences requises nécessaires à la tenue du poste-      Gérer Mettre en œuvre des techniques de biologie-      Assurer la gestion des stocks et des commandes-      Planifier ses activités en fonction des demandes à traiter-      Gérer les relations avec des interlocuteurs-      Rédiger des procédures techniques-      Exploiter et présenter les résultats des analyses, en garantir la qualité-      Utiliser des logiciels spécifiques à l’activité-      Utiliser les machines ou les appareillages dédiés aux cultures cellulaires et à l’analyse par PCRDepuis sa fondation, en 1530 par François Ier, jusqu’à nos jours, deux dispositions essentielles ont maintenu et développé sans discontinuité la valeur créatrice de cette communauté savante :Par la souplesse et le dynamisme de ce processus, le Collège de France peut s’adapter en permanence à l’évolution des sciences et rester ainsi un pôle d’animation de la communauté scientifique. Le Collège de France ne cesse de vérifier cette phrase d’un de ses professeurs, Maurice Merleau-Ponty : « Ce que le Collège de France, depuis sa fondation, est chargé de donner à ses auditeurs, ce ne sont pas des vérités acquises, c’est l’idée d’une recherche libre ».Le Collège de France est voué à la recherche fondamentale. Il a, en outre, l’obligation de diffuser les résultats de cette recherche dans le cadre d’un enseignement particulier. Les professeurs sont tenus d’enseigner « le savoir en train de se faire ».Les chaires du Collège de France intéressent les domaines les plus variés : mathématiques, physique, chimie, biologie, histoire, archéologie, linguistique, orientalisme, philosophie, sciences sociales…Elles ne sont pas permanentes : le principe de mutabilité des chaires évite la rigidité des grilles de disciplines. À l’initiative de l’assemblée du Collège de France, le titre d’une chaire devenue vacante peut être maintenu ou le plus souvent transformé : un mathématicien peut succéder à un historien ou un linguiste à un économiste. Aucun grade universitaire n’est requis pour celui qui se présente aux suffrages, seules comptent l’importance et l’originalité de ses travaux. Ainsi, le Collège jouit non seulement d’une liberté considérable dans ses activités d’enseignement et de recherche mais s’adapte aussi aux progrès réalisés dans tous les domaines de la connaissance.Enseigner librement la recherche en train de se faire à tous les publics intéressés, faciliter la diffusion des connaissances, favoriser l’émergence de disciplines nouvelles et l’approche multidisciplinaire de la recherche de haut niveau, contribuer à l’image internationale de notre pays dans les domaines de la recherche et de la culture, telles sont, depuis des siècles, les missions du Collège de France. Dans un monde en perpétuel changement, confronté au développement des connaissances sans précédent, au foisonnement des informations, aux nouvelles techniques de communication et aux adaptations sociales et professionnelles indispensables, ces missions sont plus que jamais d’actualité.Le Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie (CIRB), situé au Collège de France dans le centre de Paris, est une structure de recherche associant le Collège de France, le CNRS et l’INSERM.Le Centre est composé de plusieurs équipes de recherche indépendantes dont les travaux s’intéressent à de multiples aspects de la biologie allant de la théorie, l’evo-devo, la microbiologie, la biologie cellulaire et le développement, le cancer, les maladies cardiovasculaires aux neurosciences. Il comprend plusieurs plateformes techniques de pointe en support de ces équipes, en particulier en imagerie et en expérimentation animale. Le CIRB continue à développer des interactions fortes avec des institutions de PSL, telles l’Ecole Normale Supérieure et l’Institut Curie.Environnement de travailLe laboratoire travaille dans le domaine de l’étude moléculaire du développement embryonnaire des mammifères, en particulier sur le contrôle de la fonction des gènes impliqués. Il utilise comme système modèle des pseudo-embryons produits à partir de cellules souches ES cultivées in vitro.