Post Doc - Analyses multi-omiques de l'effet de la pollution à l'ozone sur deux plantes modèles: la lava F/H

L’UJM propose un environnement scientifique international stimulant.La personne recrutée sera membre du réseau de collaborateurs du projet de l’ANR Pollucom incluant le Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE, UMR CNRS 5175 Montpellier) - l’Ecotron européen de Montpellier (UAR 3248)  - le laboratoire de biotchnologies végétales (LBVpam , UMR CNRS 5079, Univ. Jean Monnet, St Etienne)  - l’Institut d’Ecologie et des Sciences de l’Environnement de Paris (iEES-Paris, UMR CNRS 7618, Paris).COMPÉTENCES PROFESSIONNELLES      Est attendu un.e postdoctorant.e très motivé.e pour caractériser l’impact de l’élévation de la concentration en ozone atmosphérique et de la température sur le métabolisme spécialisé des COV des figues et des lavandes ainsi que leurs systèmes antioxydants. La personne retenue générera et annotera des transcriptomes et les reliera à des données métabolomiques. Elle caractérisera les mécanismes de réponse des plantes en utilisant des approches multi-omiques, telles que, par exemple, la méthode GNPS (Global Natural Product Social Molecular Networking) ou des techniques similaires.L’Université Jean Monnet est une université pluridisciplinaire qui rassemble plus de 20 000 étudiants sur 5 campus à Saint-Étienne et Roanne.Elle propose une offre de formation dans les domaines des sciences, technologies, santé, sciences humaines et sociales, droit, économie, gestion, arts, lettres et langues.Bénéficiant d’une importante ouverture à l’international, l’UJM offre aussi une expertise toute particulière dans l’accompagnement à la réussite étudiante et à l’insertion professionnelle, dans un cadre de vie étudiante riche et dynamique. Aujourd'hui, la stabilité des écosystèmes et la biodiversité sont clairement affectées par les changements environnementaux rapides dus aux activités humaines. Malheureusement, les impacts et les cascades de modifications qu'elles engendrent sont peu caractérisés. La pollinisation est un service important à la fois pour les écosystèmes naturels et agricoles. Les insectes pollinisateurs jouent un rôle majeur dans le maintien de la reproduction de plus de 75 % des angiospermes et des cultures vivrières. La grande majorité des interactions entre plantes et pollinisateurs se fait par voie chimique. Les composés organiques volatils produits par les plantes attirent les pollinisateurs. Ces substances chimiques se diffusent dans l'air ambiant et certaines sont détectées par les antennes des pollinisateurs.  Comme la reconnaissance des odeurs florales par les pollinisateurs repose sur un mélange de COV dans des proportions spécifiques, tout changement qualitatif ou quantitatif peut entraîner l'impossibilité de localiser les fleurs. Parmi les polluants atmosphériques, l'ozone troposphérique, en générant un stress oxydatif, est l'un des plus nocifs pour les organismes.  Les niveaux de fond d'O3 ont aujourd'hui approximativement doublé par rapport au début des années 1900 et les pics élevés d'O3 sont aujourd'hui fréquents. Malgré cet effet potentiellement dramatique, on sait peu de choses sur les conséquences de l'augmentation des niveaux d'O3 sur les interactions entre plantes et pollinisateurs. En effet, une perturbation de la capacité des pollinisateurs à localiser leurs fleurs hôtes pourrait avoir des conséquences dramatiques sur la santé des plantes et des pollinisateurs, altérant le fonctionnement des écosystèmes naturels mais aussi les services écosystémiques dans l'agriculture.Le projet Pollucom étudie l'effet de l'O3 et son impact dans un contexte d'augmentation de la température, sur les interactions plantes-pollinisateurs. Deux systèmes de pollinisation sont étudiés : un système spécialisé, Blastophaga psenes (Hymenoptera, Agaonidae) - Ficus carica (Moraceae) et un système généraliste, Bombus terrestris (Hymenoptera, Apidae) - Lavandula angustifolia (Lamiaceae). Les expérimentations seront réalisées dans des mésocosmes à l'Ecotron européen de Montpellier où la concentration en O3 et la température seront contrôlées.La personne recrutée doit disposer d'une solide expérience en bioinformatique, en datamining de grands jeux de données et d'une bonne connaissance de la métabolomique et de la biologie moléculaire,La personne recrutée devra être diplomé.e, avant le 01/10/25, d’un doctorat en bioinformatique, biologie des systèmes, datascience appliquées aux données omiques ou dans des domaines étroitement liés, avoir de l’expérience dans l'analyse de données à haut débit (en particulier la métabolomique et la transcriptomique) avec d’excellentes compétences en programmation (Python ou autre langage) et maîtriser R.La personne recrutée doit être capable d'écrire et de parler couramment l'anglais et avoir de bonnes compétences en communication.Des connaissances  en écologie végétale et en biochimie des COV seront un plus.Grâce à sa formation de haut niveau, sa recherche sur des segments de pointe, son attractivité internationale, et la modernisation de ses campus, elle est une université qui se transforme selon un projet d’établissement responsable et humain.PRESENTATION DU LABORATOIRELe LBVpam étudie la production et l’émission de composés organiques volatils (COV) des plantes dans le cadre de deux axes de recherche, leur diversité et leur biosynthèse. Le laboratoire travaille sur plusieurs espèces (roses, mousses, pétunia, pelargonium, lavandes et figues) pour décrypter les mécanismes de biosynthèse aux niveaux moléculaires et cellulaires et pour comprendre le rôle des COV dans les interactions intra-plantes ou plantes-insectes.  Ces composés sont en effet importants à la pollinisation des plantes par les insectes.