Description des missions
Contexte de travail :
Profil recherché
Contexte de travail :La plateforme Gentyane propose une offre de service de séquençage "long-reads" avec les technologies développées par Pacific Biosciences (Revio) et par Oxford Nanopore Technologies (Promethion 2), ainsi qu'une offre de séquençage "short reads" avec le séquenceur Aviti d'Element Biosciences actuellement en production. Votre mission consistera à assurer le traitement bio-informatique des données issues de ces technologies et de délivrer les données traitées aux clients.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.Vous exercerez votre activité au sein de l'infrastructure scientifique collective GENTYANE, dirigée par Charles Poncet. La plateforme propose des services en génomique, en particulier du génotypage et du séquençage courts et longs fragments. Au quotidien, vous travaillez en étroite collaboration avec les personnels de GENTYANE, ses clients et la plateforme Bioinformatique du GDEC dirigée par Pauline Lasserre-Zuber. Vous devrez également interagir avec le personnel du Mésocentre de l'Université Clermont-Auvergne (UCA) qui héberge et administre notre infrastructure de stockage et de calculs. Vous serez encadré.e directement par Véronique Gautier (Ingénieure d’Etude). Vous serez également amené.e à travailler sur les données de génotypage produites sur la plateforme.Vous assurerez la maintenance des serveurs (mises en réseau, mises à jour, débogage), ce qui nécessitera d'interagir avec les supports techniques des fournisseurs (PacBio, ONT et Element Biosciences) et les supports informatiques internes à INRAE et l’UCA.Vous serez plus particulièrement en charge de :Prise de poste souhaitée au 01/08/2025.Le site de Crouël est directement desservi par les lignes de bus régulières T2C n°9, n°35 et n°36.