: Ingénieur d'études en microbiologie (H/F)
Description des missions
Missions :
Le candidat ou la candidate prendra part au projet VORTEX dont l’objectif principal est d’analyser des composés organiques volatils (COV) dans l’air expiré de patients pour développer un outil de diagnostic rapide d'infections respiratoires émergentes (virales et bactériennes). Pour ce poste, la personne recrutée travaillera sur i) la caractérisation du volatilome de souches cliniques de Legionella pneumophila isolées par un partenaire hospitalier, et ii) l’exploration du rôle de certains COV clés au cours du cycle infectieux de la bactérie. Ce deuxième axe comprend notamment une approche métabolomique chez Legionella pneumophila ainsi que l’utilisation de mutants chez cette souche.
Activités :
- Culture bactérienne (avec et sans cellules) puis mesure de COV en SPME-GC/MS
- Analyse des chromatogrammes GC et identifications des différents COV
- Création de mutants de délétion de Legionella pneumophila pour des enzymes d’intérêt
- Approche moléculaire de la réponse bactérienne à certains COV (WT et mutants) par PCR et RTqPCR
- Mise en place d’une approche métabolomique non ciblée chez Legionella pneumophila
- Présentation des résultats lors des réunions hebdomadaires
Contexte de travail :
Le laboratoire d’Écologie et Biologie des Interactions (EBI) est une Unité Mixte de Recherche (UMR CNRS 7267) de l’Université de Poitiers, rattachée à l’Institut Ecologie et Environnement (InEE) du CNRS dont les thématiques scientifiques s’articulent autour des interactions entre espèces hôtes, microorganismes et facteurs du milieu. Ces thèmes sont abordés par une approche intégrée qui va de la molécule à l’organisme et jusqu’aux écosystèmes.
Le candidat ou la candidate travaillera dans le cadre d’un projet PEPR MIE financé par l’ANRS (VORTEX) sur la mise en place d’une méthodologie permettant la détection et l’identification de pathogènes pulmonaires via l’analyse de COV. Il/elle intégrera l’équipe Microorganismes-Hôtes-Environnements (MHE) du laboratoire et interagira principalement avec le Dr Julien Verdon. Il y aura également des échanges avec plusieurs autres partenaires du projet basés à Lyon. Au cours du contrat, il y aura également des présentations sur l’avancement des résultats à faire devant les différents partenaires, en visioconférence et lors de déplacements à Lyon.
Profil recherché
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.