Ingénieur d'études en biologie moléculaire des plantes (H/F)
Description des missions
Missions :
L'équipe étudie la régulation des Eléments Transposables (séquences répétées d'ADN potentiellement mobiles et/ou régulatrices) et des éléments mobiles chez la plante modèle Arabidopsis : les bases moléculaires de leur activation en réponse à des stress biotiques et les mécanismes épigénétiques qui peuvent les contrôler négativement.
La mission consiste à disséquer la régulation d’éléments transposables et éléments mobiles (T-DNA) durant l’interaction Arabidopsis-Agrobacterium en mettant en œuvre différentes méthodologies en lien avec l’analyse de la chromatine, de l’ARN et des protéines afin de finaliser une étude en cours. De plus, la mission consiste aussi à servir de soutien ad hoc à différents projets du laboratoire.
Activités :
• Activité 1 : Mise en œuvre de méthodologies pour l’étude de la régulation d’éléments transposable durant l’interaction Arabidopsis-Agrobacterium : Culture de plantes in vitro - infection par Agrobacterium - coloration GUS - western blot - extraction d’ARN et RT-qPCR - clonage - exploration et visualisation de données de séquençage ONT long-read disponibles sur Integrative Genome Browser (IGV)"
Activité 2 : Apporter un soutien technique ad hoc aux projets de recherche développés dans l'équipe : génotypage -obtention et collecte du matériel biologique quand nécessaire- aide à immunoprécipitation de la chromatine
Activité 3 : Interagir avec les services de soutien et support (magasin, serres) de l'I2BC-participation aux commandes, au maintien de la base de données, à la gestion des stocks
Activité 4 : Présentation et communication des résultats en réunion d’équipe et séminaire de département
Contexte de travail :
Le poste est à pourvoir dans l'équipe ERTEA qui mène des études sur la régulation épigénétique des éléments transposables chez la plante modèle Arabidopsis thaliana. Il s'agit d'une équipe dynamique essentiellement constituée d'étudiants en M1 et M2 (généralement 1 à 2 par an), doctorants ou chercheurs contractuels (généralement 1 à 3) et une ingénieure d'étude CNRS, avec un fort esprit collaboratif et de discussion au sein de ses membres. L'équipe possède de nombreuses collaborations en France et à l'étranger et fait partie de deux réseaux CNRS nationaux « Epiplant » et « Mobile DNA ». L'équipe est située dans un tout nouveau bâtiment de l'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) au sein du département de Biologie des Génomes.
Contrat de 6 mois pour finaliser une étude (extension de 1 mois possible en fonction des besoins).
Profil recherché
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.