Ingénieur d'études en biologie F/H

Mission principale:

Mission principale:L’équipe Immunologie Intégrative du Cancer dirigée par le Dr Jérôme Galon (Inserm UMRS1138, Université Paris Cité, Centre de Recherche des Cordeliers) étudie les interactions entre le système immunitaire et le microenvironnement tumoral afin d’identifier de nouveaux biomarqueurs prédictifs de réponse aux immunothérapies.L’ingénieur(e) participera à deux projets centrés sur l’optimisation et l’exploitation du test Immunoscore-IC, visant à renforcer sa standardisation sur différentes plateformes technologiques et à approfondir son intégration analytique grâce à des outils numériques avancés.Connaissances:·    Solides bases en immuno-oncologie et microenvironnement tumoral·    Maîtrise des techniques d’IHC automatisée et chromogénique·    Connaissance des HALO et d’analyse spatiale·    Anglais scientifique lu et écritSavoir-faire:Optimiser, exécuter et valider des protocoles IHC sur plateformes automatisées·     Exploiter des images tissulaires complexes avec des outils d’analyse numériqueL’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique. · Projet 1: Optimisation de l’Immunoscore-IC sur la plateforme COMET et affinage des pipelines computationnels.Transfert et optimisation du test Immunoscore-IC (PD-L1/CD8) sur la plateforme COMET (Lunaphore). Calibration des paramètres de coloration, optimisation des performances analytiques et affinage des scripts R afin d’automatiser la quantification cellulaire, calculer les métriques spatiales et standardiser le score Immunoscore-IC.· Projet 2: Immunoscore-IC classique sur Leica BOND RX et analyse via pathologie numérique. Réalisation et analyse du test Immunoscore-IC classique sur la plateforme Leica BOND RX à partir de cohortes de patients atteints de cancer colorectal ayant reçu différents traitements. Supervision du double marquage PD-L1/CD8, contrôle qualité, numérisation des lames et analyses spatiales via HALO et R. Production de résultats destinés à soutenir les études translationnelles et les publications du laboratoire.Activités principales:·    Réaliser, optimiser et valider des colorations IHC automatisées·    Numériser et préparer les lames, assurer la gestion et le contrôle qualité des images·    Analyser quantitativement les tissus via HALO et R (segmentation, densité, colocalisation, métriques spatiales)·    Intégrer et interpréter les données issues des plateformes COMET et Leica·    Rédiger, actualiser et documenter les protocoles expérimentaux·    Participer à la veille scientifique et aux réunions de suivi de projet·     Réaliser des analyses quantitatives et statistiques rigoureuses·     Collaborer efficacement dans un environnement pluridisciplinaireAptitudes:·    Rigueur scientifique, autonomie et sens du détail·    Excellente organisation et gestion des priorités·    Réactivité, esprit d’équipe et approche analytiqueProfil:·   Formation en biologie (niveau Bac +5) souhaitée·   Expérience confirmée dans l’utilisation des systèmes HALO, COMET et Leica BOND RXRejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.L’équipe « Immunologie Intégrative du Cancer » de l’Inserm UMRS1138, dirigée par le Dr Jerôme Galon, est rattachée au Centre de Recherche des Cordeliers (CRC). Notre objectif est de comprendre la progression tumorale et la réaction immunitaire contre le cancer, depuis les lésions précancéreuses jusqu’aux métastases, en combinant biologie intégrative et bio-informatique. Ces approches visent à améliorer la prise en charge immunothérapeutique des patients atteints de cancer. Les projets de recherche portent notamment sur l’analyse de l’immunité préexistante et de sa modulation au cours du développement tumoral.