Ingénieur.e d'études en bio-statistique F/H - 278

En tant qu’ingénieur.e d’études en bio-statistique, vous ferez partie du programme ERC Synergy SPHERES (https://erc- spheres.univ-tlse3.fr/) dont l’objectif est de comprendre la dynamique et les conséquences de l'hypertrophie adipocytaire. L'augmentation de la taille des adipocytes est le paramètre le plus fortement liée aux maladies cardiométaboliques. Le projet inclut également le laboratoire du Prof. Ryden à l'Institut Karolinska (Stockholm) et le laboratoire du Dr. Bruno Antonny à l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (Nice-Sophia Antipolis).

En tant qu’ingénieur.e d’études en bio-statistique, vous ferez partie du programme ERC Synergy SPHERES (https://erc- spheres.univ-tlse3.fr/) dont l’objectif est de comprendre la dynamique et les conséquences de l'hypertrophie adipocytaire. L'augmentation de la taille des adipocytes est le paramètre le plus fortement liée aux maladies cardiométaboliques. Le projet inclut également le laboratoire du Prof. Ryden à l'Institut Karolinska (Stockholm) et le laboratoire du Dr. Bruno Antonny à l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (Nice-Sophia Antipolis).Connaissances :Biostatistiques : plans d’analyse, tests, correction du risque alpha (multiples comparaisons), modèles multivariés, notions de validation.Bioinformatique appliquée aux données omiques (RNA-seq et/ou protéomique, lipidomique, métabolomique, etc.) et principes d’intégration multi-omique.Programmation et analyse de données : R et/ou Python, manipulation de données, visualisation.Gestion et structuration des données : formats omiques usuels, métadonnées, notions FAIR/traçabilité.Culture générale en physiologie/physiopathologie des maladies métaboliques et notions sur la biologie du tissu adipeux.L'Université de Toulouse est un établissement public expérimental (EPE) d’enseignement supérieur et de recherche. Elle se classe aujourd'hui parmi les premières universités françaises par son rayonnement scientifique, la diversité de ses laboratoires et les formations qu'elle propose en sciences, santé, sport, technologie et ingénierie. Dotée d'un budget de 430 M€, de 5 composantes et d’1 établissement-composante (l’Ecole d’ingénieurs de Purpan), elle est forte de plus de 4300 personnels dont 2500 personnels d'enseignement et/ou de recherche, possède 69 structures de recherche (dont 42 unités mixtes de recherche), accueille plus de 35 000 étudiantes et étudiants. Elle est implantée dans 4 départements, 8 villes et est répartie sur 11 sites pour une superficie de 264 hectares. Le projet SPHERES étudie différents modèles humains et murins dans lesquels la taille des gouttelettes lipidiques des adipocytes est anormale et pour lesquels de nombreuses données « omiques » sont acquises.Votre mission principale consistera à réaliser des analyses biostatistiques multi-omiques de ces données afin de mieux comprendre les signatures présentes qui contrôlent la taille des gouttelettes lipidiques, les fonctions du tissu adipeux et les conséquences physiopathologiques des altérations.Vos activités principales :-Développement de pipelines d’analyses biostatistiques et bioinformatiques : traiter et intégrer différents ensembles de données et réaliser des analyses afin d’expliquer les relations entre ces données.-Programmation en R : développer des scripts, tester et valider les résultats, préparer un code réutilisable, partageable et facilement compréhensible par d’autres.-Gestion des données : travailler selon une discipline structurée où le code et les données sont stockés de manière efficace, facilement accessibles et partageables (principes FAIR).-Biologie et physiopathologie : comprendre et réfléchir aux problématiques biologiques sous-jacentes aux données étudiées.Savoir-faire technique :Concevoir et exécuter des pipelines d’analyse robustes (du contrôle qualité à l’interprétation biologique) sur des données omiques et multi-omiques.Mettre en œuvre des analyses statistiques adaptées au contexte (gestion des covariables, effets de lot, multiples tests, analyses longitudinales si besoin).Assurer la qualité des résultats : contrôles, traçabilité, reproductibilité, documentation claire des choix méthodologiques et des limites.Structurer et gérer des jeux de données complexes (omiques et autres) : harmonisation, dictionnaires de variables, gestion des versions.Produire des livrables exploitables : figures, tableaux, rapports d’analyse, scripts/pipelines, et supports de présentation (PowerPoint).Présenter et discuter les résultats avec les membres de l’équipe, proposer des recommandations méthodologiques.Planifier et coordonner les étapes d’analyse en lien avec les priorités des projets (délais, jalons, itérations, demandes partenaires).Savoirs comportementaux :Rigueur scientifique et sens de l'organisationGoût pour le travail en équipe et bonne communicationAutonomie progressive et capacité à gérer plusieurs tâches en parallèleEsprit d’initiative et capacité d’adaptation à des protocoles expérimentaux évolutifsBonnes capacités de communication orale et écrite en français et en anglais scientifique Diplôme requis : BAC+5 (Master, Diplôme d'ingénieur)Expérience souhaitée : Débutant.e accepté.eL’établissement est engagé dans la construction du site toulousain à travers la future transformation en Grand Etablissement en capacité de coordonner, à l’issue de la période d’expérimentation, la stratégie de recherche et de formation du site. La construction de l’EPE implique vingt établissements associés ou partenaires de l’enseignement supérieur et organismes nationaux de recherche, deux établissements de santé et d'autres organismes. Pour atteindre cet objectif, elle s’inscrit dans une feuille de route partagée avec ses établissements associés et partenaires et également dans un plan de transition visant à intégrer d’ici le 31/12/2027 les activités et moyens actuellement portés par la Comue.L'Institut des maladies métaboliques et cardiovasculaires I2MC ( https://www.i2mc.inserm.fr) développe des programmes de recherche sur les mécanismes physiopathologiques impliqués dans les maladies métaboliques (obésité, diabète et dyslipidémie) et les complications cardiovasculaires (maladies vasculaires, thrombose, athérosclérose, insuffisance cardiaque et rénale). L'I2MC dispose d'une expertise reconnue en biologie cellulaire, en modèles murins et en travaux cliniques, soutenue par des équipements technologiques en imagerie cellulaire, cytométrie, lipidomique, génomique, protéomique et phénotypage de souris. L'I2MC offre des opportunités de travailler sur des maladies chroniques majeures dans l'environnement très apprécié de Toulouse.Pour ce poste d’ingénieur-e d’études en bio-statistique, vous conduirez votre activité dans le laboratoire AdipoLive (https://www.i2mc.inserm.fr/en/equipe- langin/) de l'I2MC qui étudie les métabolismes du tissu adipeux et du foie dans les maladies métaboliques. Le laboratoire est composé de scientifiques maitrisant différentes spécialités (biologie moléculaire et cellulaire, biochimie, modèles de souris et phénotypage, études cliniques).Vous travaillerz sous la supérvision du Prof. Dominique Langin (chercheur principal du projet ERC SYNERGY SPHERES et directeur de l'I2MC) et du Dr. Jason Iacovoni (ingénieur de recherche, plateforme biostatistique et bioinformatique de l’I2MC).