Description des missions
La personne recrutée aura pour mission de concevoir, de mettre en œuvre et de réaliser des expériences en culture cellulaire avec des cellules souches et des organoïdes. Il ou elle sera également en charge de l’analyse de ces différents types cellulaires et modèles complexes via des approches en biologie moléculaire. Enfin, il ou elle assurera un rôle dans la coordination des activités de la PF au service des sollicitations des partenaires des autres projets ciblés.
Profil recherché
La personne recrutée aura pour mission de concevoir, de mettre en œuvre et de réaliser des expériences en culture cellulaire avec des cellules souches et des organoïdes. Il ou elle sera également en charge de l’analyse de ces différents types cellulaires et modèles complexes via des approches en biologie moléculaire. Enfin, il ou elle assurera un rôle dans la coordination des activités de la PF au service des sollicitations des partenaires des autres projets ciblés.- Mettre en oeuvre les techniques de culture de différents types de cellules souches et de leur induction en organoïdes selon les protocoles d’obtention spécifiques dédiés à différents tissus d’intérêt.- La personne devra maîtriser la culture des cellules souches (PSCs, iPSCs) et leur induction dans au moins un type d’organoïdes comme ceux de cerveau, foie, intestin, glande mammaire, etc… à l’aide des techniques classiques de culture cellulaire ainsi que leur analyse à la fois en biologie moléculaire et biochimique.- La personne devra avoir connaissance des concepts de dérivation et d’établissement de lignées cellulaires, notamment des cellules reprogrammées.- Les approches d’analyse de l’expression des gènes, notamment par PCR en temps réel et par analyse des protéines (Western blot, dosage protéique, ELISA, immunocytochimie, etc…. ) devront être maîtrisées.Le SBRI « Stem cell and Brain Research Institute», U1208, INSERM, USC1361, INRAE, UMS1208, UCBL1, situé sur le campus Hospitalier Lyon-Est, est un laboratoire pluridisciplinaire utilisant un large éventail d’approches, dédié à l’étude des cellules souches et de la neurobiologie du primate humain et non humain. Les principaux objectifs de recherches sont la biotechnologie des cellules souches et la neurobiologie du primate, avec un accent particulier sur le développement, la structure et la fonction du cortex cérébral normal et pathologique. - Développer de nouvelles lignées de cellules reprogrammées à partir de cellules primaires.- Mettre en œuvre et utiliser les outils moléculaires et cellulaires pour mener à bien les tests de caractérisation des différents types cellulaires et organoïdes obtenus.- Assurer le suivi technique des projets développés au sein de la PF en lien avec le responsable pour les demandes des autres projets ciblés.- Conduire en spécialiste la réalisation du projet méthodologique dans le domaine de la biologie avec des approches en biologie cellulaire, moléculaire et biochimie.- Consigner les plans expérimentaux, le suivi des protocoles, les produits et réactifs utilisés ainsi que l’ensemble des données obtenues dans le cahier électronique.- Diffuser et valoriser les résultats des développements méthodologiques sous forme de rapport technique, de présentation orale, et de participation aux publications et brevets qui seront issus du projet.- Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques expérimentales en biologie ; encadrer les utilisateurs.- Les approches d’analyse par microscopie (fluorescence, confocale,…) devront être connues.- L’utilisation des outils en ligne de dessins d’oligonucléotides, d’analyse et de comparaison de séquences est un prérequis- Les logiciels d’analyse de transcriptomique (RNAseq, scRNAseq, …. ) seront un avantage.- Des connaissances en infectiologie et virologie seront également un avantage.- Le savoir-faire en biologie cellulaire doit permettre la mise en œuvre de façon autonome de protocoles d’entretien, de caractérisation et d’analyses des cellules souches et de leur induction en organoïdes.- Le savoir-faire en imagerie doit permettre la réalisation et le suivi de l’analyse de marqueurs, notamment par immunocytochimie.- La connaissance des méthodologies et techniques d’analyse génique par PCR en temps réel et par « omics » doit être effective pour permettre le développement de ces techniques en fonction de l’appareillage disponible.L’équipe de B. Pain vise à étudier et comparer les mécanismes de pluripotence dans différentes espèces dont l’homme, le bovin, le porc et le cheval, mais aussi les oiseaux. Dans cet environnement et dans le cadre du projet PEPR Elevage Durable ((https://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/fr/pepr-elevages-durables-un-programme-pour-accompagner-la-transition-101374), l’équipe contribue à la mise en place de la nouvelle Plateforme OrganoZoo pour accompagner les autres projets ciblés du projet.
