Doctorant-e : S'inspirer de modèles naturels résistants à l'atrophie musculaire pour trouver de nouvelle H/F

Le/la doctorant/e recruté/e (DF01) réduira l'expression de ces ligases E3 dans des myotubes de rongeurs en culture, soumis ou non à des conditions cataboliques, afin de confirmer ou d'infirmer leur implication dans le processus d'atrophie. L'étudiant mesurera : le diamètre des myotubes ; la quantité de protéines contractiles [par immunoblotting] ; les niveaux d'expression d'atrogènes tels que MuRF1, MAFbx, Atg8 [par ddRT-PCR].

Le/la doctorant/e recruté/e (DF01) réduira l'expression de ces ligases E3 dans des myotubes de rongeurs en culture, soumis ou non à des conditions cataboliques, afin de confirmer ou d'infirmer leur implication dans le processus d'atrophie. L'étudiant mesurera : le diamètre des myotubes ; la quantité de protéines contractiles [par immunoblotting] ; les niveaux d'expression d'atrogènes tels que MuRF1, MAFbx, Atg8 [par ddRT-PCR]. La localisation subcellulaire du candidat E3 le plus prometteur sera évaluée par immunofluorescence sur des fibres musculaires de souris extraites.Diplôme exigé : Master ou diplôme équivalent en biologieCompétences techniques :Culture cellulaire (asepsie, maintenance de lignées, transfection cellulaire, tests fonctionnels).Biochimie des protéines (extraction, quantification, western blot, purification)Compétences analytiques et théoriques :Conception d'expériences (par exemple, inclusion de contrôles appropriés (contrôles négatifs et positifs, contrôles de chargement, etc.))Bio-informatique de base (outils d'alignement de séquences, utilisation de bases de données (par exemple, Uniport, PDB))Analyse statistique (GraphPad Prism ou R)Compétences relationnelles :  Pour ce candidat E3, les mécanismes sous-jacents au phénotype observé seront étudiés en identifiant les partenaires d'interaction directs par criblage « yeast two-hybrid » sur une banque d'ADNc musculaire humain (sous-traitance). L'étudiant confirmera et caractérisera les interactions avec le partenaire identifié à l'aide d'approches biophysiques et/ou intracellulaires complémentaires [résonance plasmonique de surface, Monolith ou SplitGFP]. Il déterminera ensuite si ces partenaires sont des régulateurs ou des cibles de la ligase E3 candidate à l'aide d'un test de dégradation intracellulaire.Ce projet de thèse sera mené en collaboration avec Vincent Gache, de l'Institut NeuroMyogène, situé au 8 avenue Rockefeller, à LyonDirectrice (70%): Cécile POLGECo-directrice (30%): Lydie COMBARETLieu de travail : UNH, Centre de Recherche INRAE, Route de Theix, 63122 Saint Genès ChampanelleCapacité à mener plusieurs tâches de front avec rigueur,Résilience et capacité à résoudre les problèmesCuriosité scientifiqueAutonomie et gestion du tempsMots clés : Atrophie musculaire ; protéolyse ; ubiquitine ligase ; myotubes de rongeurs en culture ; localisation subcellulaire ; interactomiqueCritères obligatoiresLe doctorant :ne doit pas avoir résidé ni exercé son activité principale (travail, études) dans le pays où il est recruté, à savoir la France, pendant plus de 12 mois au cours des trois années précédant la date limite de dépôt des candidatures, sauf si cette période s'inscrit dans le cadre d'un service national obligatoire ou d'une procédure d'obtention du statut de réfugié au titre de la Convention de Genève.doit être doctorant (ne pas être déjà titulaire d'un doctorat à la date limite de dépôt des candidatures).Les compétences orales et écrites doivent répondre aux normes de l'anglais académique utilisé dans la recherche internationale.